結合了兩代X戰警的戰力，展開有史以來最浩大的抗爭。包含魔形女、暴風女、小淘氣、野獸等全員到齊。而延續《X戰警：第一戰》之後的發展，他們必須改變過去的歷史，以拯救未來變種族群的存活。 在萬磁王與X教授兩派陣營分裂後，因戰役而失去雙腿及義妹魔形女的X教授從此失魂落魄。為阻擋變種人面臨被趕盡殺絕的命運，X教授與萬磁王派金鋼狼穿越時空回到過去，企圖讓當時落魄的X教授振作起來，並由兩派變種人團結合力改變過去，共同對抗造成變種人未來最大威脅的頭號公敵─崔斯克。